流浪動物零撲殺政策將於今年2月4日上路，澎湖縣政府強調將配合新政策辦理，然而現有的公立收容所空間有限，收容隻數已經飽和，縣府計畫擴建收容中心空間，預計今年發包興建，但在擴建完成前，仍呼籲各界積極認養，一般飼主勿隨意棄養動物。
農漁局表示，現有的流浪動物收容中心其空間適宜收容的流浪動物隻數為80隻至100隻，超過100隻便容易造成犬隻壓力、窘迫，生活品質大為下降，對健康造成不利影響，而澎湖因空曠地多，流浪犬易聚集成群而帶有野性，屢有傷人情事，縣府幾乎天天接獲民眾投訴與加強捕捉等要求，縣府積極捕捉之下，仍盡可能的避免進行人道撲殺。
以去年一至十一月份的統計，收容中心共收容874隻犬隻，其中351隻被認養，認養率約40％，相較於全國平均認養率74％確實偏低，研判為澎湖屬農漁村型社會，人力老化、青年人口少，因而認養意願較低。至於人道處理及死亡比例分別為26、28％，主因則為收容空間小，具野性的犬隻相互攻擊或傳染病造成，並非刻意撲殺或虐待犬隻致死。
縣府表示，中央的政策就是2月4日起執行零撲殺，縣府當然會配合辦理，因此除了擴建收容中心之外，將依中央政府的政策指導，採上限管制方式，一旦收容量達飽合，即停止捕捉不再進所，以維持收容所生活與性命延續，所以縣府將謹慎力守精確捕捉的原則，減少收容壓力，增加結紮比率減少生產量，全力推廣認領養抒解收容數，至於近日發生野狗追捕黑面琵鷺等情事，則仍屬優先捕捉範圍。
縣府強調，零撲殺政策伴隨而來所衍生的許多問題，不但政府公立收容所準備不及，社會環境、觀念和民眾的接受度仍然有待時間來改變、調整和適應。對於立場不同和見地差異，卻遭受指責主管消極怠惰、首長為屠狗之王，縣府深感遺憾。但澎湖絕非不愛毛小孩的縣市，為了追求更高的動物福利，縣府計畫中的寵物公園預定今年完工啟用，也持續推動收容中心擴建，至於動保團體推動的校園犬及TNVR措施，推動過程中仍有部分歧見尚待克服，此一部份將持續進行溝通。
