12月31日傳出中國湖北省武漢市出現數名不明病毒性肺炎病例。對此，我國衛福部疾管署為求慎重，宣布自即日起針對武漢直航入境台灣的班機進行登機檢疫、主動評估旅客健康情形與宣導。 （圖／衛福部疾管署）
去（2019）年12月31日傳出中國湖北省武漢市出現多起不明肺炎病例（現已被WHO正名為2019新型冠狀病毒），再加上前些年SARS、MERS疫情影響，因此衛福部疾病管制署已公告，把「嚴重特殊傳染性肺炎」列為第五類法定傳染病，並把武漢地區的旅遊疫情調升至第二級警示（Alert）。原本中國方面一直宣稱當地僅出現41例病例，但因泰國、日本、韓國相繼出現武漢肺炎境外移入病例，且英國日前的研究報告指出，中國當地恐已出現超過1400例病例，再加上中國今（20）日凌晨突更新疫情，已突增到198例病例。對此，衛福部今（20）日下午宣布，行政院已同意該部成立中央流行疫情指揮中心，從即日起以三級開設的方式運作。
疾管署表示，該署今（20）日接獲中國疾控中心通知，武漢市於1月18至19日共新確診136例新型冠狀病毒感染之肺炎個案，分別為男性66例、女性70例，年齡介於25至89歲，最晚發病為1月18日。目前該市個案累計198例，3例死亡，治療中重症35例、危重症9例，25例出院，密切接觸者累計817例中並無新增病例，持續追蹤90人。
疾管署另指出，中國北京市大興區、廣東省深圳市今日分別新增報告2例及1例確診個案，均有武漢旅遊史，目前狀況穩定並隔離治療中；南韓公布首例境外移入確診病例，該個案為35歲居住於中國武漢市之中國籍女性，於1月19日入境仁川機國際機場發燒篩檢站欄檢，並於1月20日確診。世界衛生組織（WHO）評估本疫情已發生有限性人傳人，將持續關注是否發生持續性人傳人，並表示中國加強境內邊境監測，預期近期可能在其他省市出現個案。
因應中國武漢肺炎疫情，疾管署持續加強疫情監測與邊境管制措施，並針對國際及小三通港埠之入境發燒旅客全面詢問武漢旅遊史及進行健康評估。自去（2019）
年12月31日啟動由武漢直航入境班機之登機檢疫，已執行34航班，共檢疫3,906名旅客及機組員；昨（19）日新增1名嚴重特殊傳染性肺炎通報病例，為1歲男童，無禽畜接觸史及華南海鮮市場活動史，目前於醫院急診隔離房觀察治療中，已採檢送驗。
據疾管署最新統計，台灣截至1月19日共通報6名「嚴重特殊傳染性肺炎」個案，其中4名已排除感染新型冠狀病毒；1名A型H3N2流感且1採新型冠狀病毒陰性、待2採；另1名檢驗中。目前國內無2019新型冠狀病毒確診個案。
疾管署呼籲，目前「嚴重特殊傳染性肺炎」已列為我國第五類法定傳染病，依據傳染病防治法第31條，醫療機構人員於病人就診時，應詢問其病史、就醫紀錄、接觸史、旅遊史及其他與傳染病有關之事項；病人或其家屬，應據實陳述。疾管署強調，民眾於返國後如有疑似症狀，務必於就診時主動告知相關旅遊史及接觸史，如未據實通報，將可依傳染病防治法第69條處新台幣1萬元至15萬元罰鍰。
