國立海洋科技博物館是基隆少數的室內大型文化教育場所，多雨潮濕的環境常使人無法在戶外進行休閒活動，因此每逢假日，海科館總會吸引大批民眾前往參觀。
在海科館參觀展覽或設施的同時，也免不了會有需要使用廁所的時候。而在海科館的廁所，除了乾淨整潔外，還有一些附加設施，如廁間提供洗手乳、衛生紙；部分樓層透過自然採光達到節能減碳的效果，並配合行政院環境保護署相關政策，張貼衛生紙丟馬桶及操作型文宣標示，加以宣導民眾共同維持公廁整潔品質，此外最值得一提的是為了響應環保，海科館的廁所不僅採用節能設備，就連沖馬桶所使用的都是回收的雨水，基隆市今年度的公廁特優場所認證，海科館館方也參與其中，且全數通過認證。
基隆市環保局也加強推動「菸蒂不落地」政策，依據「廢棄物清理法」規定隨意丟棄菸蒂，將裁處新臺幣1,200元以上6,000元以下罰鍰，呼籲民眾發揮良好公德心，自備熄菸盒，並隨身攜帶存放菸蒂，可解決外出沒有垃圾桶的困擾，也避免隨手亂丟被取締開罰，期望大家一起努力，共同創造整潔美麗的生活環境。
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