儘管雲林縣環保局以十年未調漲垃圾費，且「專款基金用罄」為由，研擬調漲隨水費徵收的垃圾費，然而由於林內焚化爐興建後停止運轉，該政策有爭議，因此縣府的調漲垃圾費也引來批評。
圖說：雲林垃圾費將調漲。（記者郭春輝攝）
縣環保局因每年要支付上億元經費，將縣內十多鄉鎮垃圾轉運他縣市焚化爐處理，因該專款基金已用罄，且雲林垃圾費十年未調漲，加上目前的費率每度2.9元是全國最低，因此研擬調漲垃圾費，將從現行2.9元調高至3.7元，估計一般民眾每月要增加近百元垃圾費支出。
環保局表示，由於外縣市焚化爐垃圾處理費逐年調漲，目前雲林縣運往他縣市焚化爐的垃圾處理費負擔也增加，調漲垃圾費是不得已的做法。
不過縣府的調漲政策引起詬病，因林內焚化爐興建後不運轉，不僅要支付大筆違約保證金，且年年要支付給外縣市一筆垃圾處理費，如今這筆處理費要縣民買單並不合理。
國民黨議會黨團總召李明哲議員建議縣府，若非調漲垃圾費不可，漲幅不宜太高，且因思考輔導各鄉鎮垃圾減量，讓垃圾轉運處理量減少，民眾才不會感受到漲幅。
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