針對高思博聲稱市黨部對21世紀基金會的指控是抹黑汙衊兩岸農業交流，民進黨台南市黨部27日提出三問反擊。市黨部執行長蔡麗青1問「21世紀基金會到底有沒有與中國共同成立海峽現代農業研究院？」，2問「高育仁與高思博有沒有在海峽現代農業研究院擔任職位？」，3問「高家有無透過任何形式將台灣農種、農技輸出到中國？」，蔡麗青呼籲高思博出面將這些問題說清楚講明白。
蔡麗青提問21世紀基金會副董事長高思博，21世紀基金會到底有沒有與大陸國農業科學院、福建省農業科學院合資15億人民幣，成立「海峽現代農業研究院」？既然21世紀基金會堅稱沒有出資成立「海峽現代農業研究院」，為什麼不管是「海峽兩岸現代農業高峰論壇」會議資料，或是該研究院子公司的網頁，甚至對岸新華社的報導，都會提到這一段？
蔡麗青提出第二個問題，21世紀基金會由高育仁擔任董事長，高思博擔任副董事長，整個21世紀基金會都由高家主導。由21世紀基金會與中國共同成立的海峽現代農業研究院，高育仁與高思博是否也在裡面擔任職位？請高思博正面回答。
蔡麗青最後指出，21世紀基金會與中國共同成立的海峽現代農業研究院有一個重要任務，就是「引入台灣優良種子資源」。21世紀基金會是否透過海峽現代農業研究院及其子公司或任何形式，將台灣的農業品種、農業技術、産銷制度送往中國？這是違反《兩岸人民關係條例》的重大違法案件，希望高思博接受人民檢視，說清楚講明白。
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