行政院正式核定綠能科學園區計畫落腳於台南沙崙高鐵特定區，交通大學南部校區與長榮大學兩校同為沙崙在地的高等教育學府。兩所大學共同簽署「學術交流與合作協議書」，奠定未來結合雙方人才、設備、技術及學術交流，進行實質合作與共同研究的基礎與架構。
交通大學校長張懋中博士與長榮大學校長李泳龍博士簽署合作協議，正式完成兩校合作。雙方合作項目包括設備資源分享、專題研究與成果分享、研討會活動、就業輔導交流、技術引進等，雙方將整合兩校資源與外部網絡，共同推動各類合作方案，提升兩校學術水準，成為綠能科學城最佳人才搖籃。
交通大學張懋中校長表示，交大在台復校近一甲子，所培育出的校友共同打造台灣的高科技奇蹟。近年交大逐漸由電資資訊工程，整合生醫、轉譯領域，發展醫學工程、生命科學等創新跨域研究，期盼為台灣再創高峰。而長榮大學設立有健康科學學院、資訊暨設計學院，相信兩校的合作更加能同行致遠，共同朝「偉大大學(Great University)」邁進一大步。
長榮大學校長李泳龍則表示，雙方攜手共進，運用兩校辦學優勢與特色，發揮一加一大於二的能量，落實建構歸仁大學城的願景，並配合政府打造台南沙崙綠能科學城，協助帶動歸仁區大潭、武東、沙崙等里人文、生態、綠能科技發展，展現城市新風貌。
交通大學光電學院正以過去七年打下的基礎，積極配合國家政策以及地方產業，努力邁向2016-2020的第二期建校工程，並積極籌設「綠能暨系統設計學院」，期望四年之後，成為我國培育新時代人才之創新示範園區，培育前瞻工程及產業研發人才，並發揚校友創業拓荒精神，實現交大竹科、史丹福矽谷的台南築夢。
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