為遙祭歷年來天災人禍造成的亡魂，並宴請來自陰間好兄弟，南鯤鯓代天府每年農曆7月10日舉辦盛大的普度祭典。侯賢名總幹事表示，今年參與普度桌數近1千桌，信眾登記金紙、白米贊普者有3000人。相關普度科儀由法師團主持，儀式從中午起至下午6時。普度結束後，廟方會把白米捐給各慈善公益團體、弱勢團體、教養院、老幼協會、偏鄉學校，將愛傳給需要幫助的人。

侯賢名總幹事指出，南鯤鯓代天府農曆7月間不關廟門，各地信眾可前來參香。廟方每年農曆7月10日在廟庭廣場、五王殿前、中軍府、城隍爺殿前走廊、萬善堂走廊及廣場等設立普度場。中元普度5大斗燈首、南鯤鯓代天府董監事會、鯤鯓王先鋒官台北代府殿、萬善爺爐主、萬善爺聖誕龜王等代表普度，普度桌數近千桌。

侯賢名總幹事說，由於未開放一般信眾參與贊普，僅開放以金紙、白米贊普，每份600元。經統計，有約3000人登記贊普。普度祭祀科儀聘請法師團主持，內容有迎請大士爺開光、李府千歲大王豎普度七星燈、放水燈、送孤、巡普等，慶讚中元，祈求合境平安。贊普的白米將代為捐贈給弱勢關懷戶和社福團體，廟方感謝所有來自各方的善意。