民國98年莫拉克風災重創南部地區主要水庫上游集水區，造成大量崩塌及泥沙沖刷入庫，為有效提升常態供水能力及確保上游集水區環境保育，經營建署城鄉發展分署依穩定供水計畫提報「曾文南化烏山頭水庫集水區土地合理利用規劃實施計畫」核定後，台南市政府都發局及嘉義縣政府即配合辦理「曾文水庫特定區計畫（第四次通盤檢討）」都市計畫變更作業，並於110年9月14日第一階段發布實施。
市府都發局長莊德樑表示，第一階段發布實施案件共計42案，主要是涉及水庫治理、穩定供水及都市計畫圖重製等變更內容，本次相關檢討成果共劃設1,949.70公頃水庫專用區，並依水庫主管機關公告事項使用及管理；另配合曾文南化聯通管工程，規劃設置供水豎井、調整池、水管橋等水利建造物，將曾文水庫特定區內所需用地範圍，變更為水利設施用地；並依水庫集水區（供家用或供公共給水）、飲用水水源水質保護區、特定水土保持區、森林（國有林事業區、保安林、大專院校實驗林、林業試驗林地等森林地區）等與水資源保育直接相關規定，經圖資套繪及分析檢討後，共劃設約2,418公頃保護區。
都發局指出，曾文水庫特定區計畫於民國67年擬定發布實施，現況地形已有所變遷，且書圖老舊與精度差，常有圖、地不符情形而影響計畫執行及民眾權益。本次完成比例尺五千分之一重製計畫圖，並同步檢討毗鄰之楠西都市計畫（本市轄內）及大埔都市計畫（嘉義縣轄內）邊界範圍未重合之處，進行都市計畫縫合及開合邊界處理。
都發局補充說明，「變更曾文水庫特定區主要計畫（第四次通盤檢討）（第一階段配合水庫治理計畫及穩定供水暨都市計畫圖重製）案」相關發布實施計畫書圖刊載於市府全球資訊網首頁之「市政公告」（https://www.tainan.gov.tw/），以及市府都市發展局網站首頁之「最新公告」供公眾查閱（https://udweb.tainan.gov.tw/）。
