台北南門中繼市場業於10月17日正式試營運，市場營業時間與原市場一樣，一般零售攤(含雜貨、生鮮、蔬果、家禽、獸肉等)：上午7時至下午7時；百貨攤：上午10時至下午7時；飲食攤：上午11時至下午7時。另周一休市。

為利民眾採買便利，南門中繼市場設有24小時營業之停車場，提供106格汽車停車位及99格機車停車位，因市場與停車場營業時間差異，已於該市場東北角(杭州南路二段51號及愛國東路21巷交叉口)設有一獨立戶外梯，以供民眾於市場非營業時間利用該戶外梯出入取車。

臺北市市場處表示，現正改善南門中繼市場動線指示標示及門禁時間宣導，另2樓排油煙系統及外氣送風機產生之噪音亦於108年11月13日正式開幕前完成改善，以提供符合攤商及民眾需求之完善採買空間。

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