鳥嘴潭人工湖各項補償救濟水利署秉從優、從寬、從速原則辦理。私有土地參考市價優於徵收價格，價購比率更高達93%。而對於被取得土地的農民，其農保權益喪失，政府給予終身救濟保障亦為全國首創。另外，對於公有土地取得，因其所有權屬於國家，除375租約外依規定並無需給予補償或救濟，但為鼓勵民眾配合施工，從優核發相關救濟金每公頃182萬元，即使無取得許可占耕者亦從寬給予每公頃163萬元，均已優於國道6號案例及其他政府工程。
水利署以照護居民的最大溝通誠意，已召開達27場協調會!又考量在地民眾多有年紀較大、行動不便之長者，本署中區水資源局除當地成立臨時辦公室就近積極主動服務民眾外，並不分平、假日採一對一通知說明及到府發放服務。
水利署強調，鳥嘴潭人工湖工程已通過環評審查，因為並非屬於一般水庫，無劃設集水區水質水量保護區之需要，而近年堰址河川水質調查，目前均符合飲用水水源水質標準，未來配合上游埔里鎮及國姓鄉污水下水道系統積極建置，及南投縣政府加強上游汙染源稽查，可確保水源水質安全。
水利署表示，目前工程已開工，雖仍有部分耕戶希望提高救濟金額的訴求聲音，將持續積極溝通化解歧見，以儘速推動期能儘早創造供水效益。
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