聖約翰科技大學自103學年度開始，申請勞動部勞動力發展署「雙軌訓練旗艦計畫」開設專班，透過「做中學」訓練模式，幫助學生學習務實技術順利就業，也協助企業培養需用的人才。108學年度開設「機電整合」、「工業機械」、「冷凍空調」及「工商管理」等職類，學生每週在企業工作4天、到學校上課2天，並可獲得政府至少50%學費補助。學生不但可以減輕家庭經濟負擔，更能提早進入企業、透過「師徒制」方式培訓專業技能，畢業後將比同儕取得更多優勢，畢業即就業。
「從一個門外漢到考取『CNC銑床』、『一般手工電銲』及『堆高機操作』」3張技術士證照，畢業後不但完成學業，同時學位與專業技術兼具。」今年從機械與電腦輔助工程系畢業的張錦河同學表示，高職畢業時既想繼續升學，也希望學習一技之長為就業打下好的基礎，因此決定加入「雙軌訓練旗艦計畫」，進入「天威機械工業公司」接受工作崗位訓練。這樣的選擇不但符合兼顧學業、技術的期待，更因為有勞動部的學費補助，幫助他減輕家中經濟負擔。完全沒有機械背景的錦河，透過自己的努力，加上學校教育及天威機械扎實的實務訓練，讓他一次考取3張證照，同時也將留任企業，無縫與職場接軌。
企業管理系畢業生華秋香同學說，她從唸高職開始就半工半讀，考量「雙軌訓練旗艦計畫」有政府的學費補助，以及事業單位提供的工作津貼，同時還能取得文憑，因此升大學時即選擇進入「必勝客」（富利餐飲）接受外場人員培訓。即將畢業的她已經獲得「必勝客」留用，將繼續朝管理職目標努力。
聖約翰科大108學年度共有機械與電腦輔助工程系與企業管理系開設「機電整合」、「工業機械」、「冷凍空調」及「工商管理」等職類，合作廠商包括：天威機械、春源鋼鐵、理研電器、永璽科技、大井泵浦、全球傳動科技、台灣日立、台灣開利、三商餐飲、富利餐飲、爭鮮、鬍鬚張、神腦國際及古典玫瑰園等企業，歡迎29歲以下，高中（職）畢業或同等學力者報考，考生可依據興趣選擇科系及合作企業，詳情請至學校網站瀏覽。
