原「臺南市低碳城市自治條例」對於公有建築物因規模較小，或用途特殊申請綠建築標章確有困難；為此，市府修正自治條例第21條第3項「新建公有建築物一定規模以下或用途特殊者，可免申請綠建築標章」。
臺南市推動「低碳城市」政策，積極發展各項綠色科技產業，市府特制定「臺南市低碳城市自治條例」，並自101年12月22日發布實施，對於公有或公告指定區域之新建建築物制定新式規範較中央嚴格，藉此強調臺南市落實低碳城市之決心，逐步達成永續生態低碳城市的目標。
根據「臺南市低碳城市自治條例」第21條規定「本市公有或經本府公告指定地區之新建建築物於申請建造執照時，應設置太陽能熱水系統或綠能發電系統、採用雨水貯留回收系統…等」，以取得綠建築標章。
惟實施至今，部分公有建築物因規模較小或用途特殊，無法申請綠建築標章，為與時俱進並節省公帑，市府於106年4月17日修正發布自治條例第21條第3項，並由工務局於106年5月10日公告：「新建公有建築物一定規模以下或用途特殊者包括：(1)建築物每幢總樓地板面積500平方公尺以下者。(2)四周外牆總透空率三分之二以上之風雨球場、游泳池、車棚、涼亭等類似建築物，且每幢總樓地板面積1500平方公尺以下者。(3)未供教學或行政空間使用之用農業設施、溫室、園藝設施等類似用途之建築物。」，免申請綠建築標章。
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