根據疾管署6月11日公佈資料，6月4日至10日新增328例COVID-19本土確定病例，較前一週新增263例上升，累積併發症中65歲以上長者79%，累積死亡個案中，65歲以上長者佔90%，研判疫情上升且進入流行期。台南市衛生局表示，天氣日漸炎熱，仍無法減緩病毒的傳播速度，面對病毒除接種疫苗，勤洗手、戴口罩等外，呼籲高風險族群踴躍接種疫苗。
衛生局表示，至6月20日，南市COVID-19本土確定病例(併發症)累計872例，男性個案佔61%、女性個案佔39%；年齡層以65歲以上長者居多，但12歲以下兒童達14例，有10例為0-1歲嬰幼兒。由於幼兒感染COVID-19後，個案病程變化迅速，轉變為重症的風險高，鼓勵6個月以上者可接種一劑XBB 新冠疫苗，以預防重症發生。高風險族群如65歲以上長者、幼兒、免疫力低下族群及家中有高風險族群者，接種疫苗可避免重症外，也可降低身邊親友確診的風險。
根據疾管署6月11日公佈資料，國內新冠XBB疫苗累計接種276.4萬人次，全國接種率11.36%，65歲以上第1劑及第2劑接種率分別為20.54%、1.55%。目前全國尚有莫德納XBB疫苗約288.9萬劑、Novavax XBB疫苗約4.8萬劑，呼籲尚未接種新冠XBB疫苗者，別輕視疾病威脅，應儘速接種。民眾可至台南打疫苗平台 https://health-reservation.tainan.gov.tw/covid 進行預約，亦可至37區衛生所或合約院所隨到隨打。
根據疾管署監測資料顯示，近4週變異株監測統計，本土及境外檢出變異株以JN.1為多，分別為64%及59%，近期呈緩降。另KP.2及KP.3的佔比則略升，KP.2分別為10%及22%，KP.3皆為9%，會持續監測變異株流行趨勢。衛生局表示，民眾如出現發燒或咳嗽、流鼻涕、喉嚨痛等疑似症狀，建議使用COVID-19家用快篩試劑先自我檢測，並於就醫時主動告知快篩結果。
