台南大學在考量少子化和減量開發下決議不遷校七股校區，引發地方反彈，為此，立委陳亭妃特別緊急質詢，要求教育部長潘文忠及台南大學校長黃宗顯，盡速重新研議評估，並與台南市政府共同討論如何解套。
陳亭妃指出，從94年到106年「國立台南大學校區設置計畫」，花費高達7億元的整地費用，讓七股地方民眾這十幾年來的高度期待卻要歸零，當中來來回來送了14次變更計畫給教育部，並因少子化與自籌款無法負擔，在10月18日台南大學校務會議決議不遷校七股校區。然而，今年2月台南大學也擬訂出「國立臺南大學七股校區在地深根經營計畫」，並送給教育部，隨後卻在8月17日遭教育部以請研議「遷地」與「還地」，間接性的否決掉。
陳亭妃表示，台南大學「國立台南大學七股校區在地深根經營計畫」是以國際級國家濕地生態博物館結合生態學院，推動「國際級曾文溪口濕地」範疇與「黑面琵鷺及其共棲鳥種生態保育計畫」區，成立生態旅遊和環境教育學術研究，成為國際級生態研究場域，增加台南生態保育的國際能見度，對地方發展是一件好事。
因此陳亭妃要求教育部和台南大學，重新回到今年8月17日遭教育部否決之前的計畫案，盡速重新研議評估，並與台南市政府三方共同討論，如何提高台南大學研究能量的方向，讓台南大學七股校區能繼續開發，以帶動地方學術、環境、生態、農業、產業發展的效益，而不要讓地方期待的發展，最後回到原點。
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