台南市國、私立高中職改隸臺南市政府接管案，由於改隸移撥經費短差約7億元未達共識，致無法完成管轄與監督權移轉。台南市政府教育局正秉持不影響現有國立高中職校務運作、資源及維護學生就學權益的原則，努力向國教署爭取現有經費能全數到位。

教育局指出，高中職改隸移撥經費，自105年8月至106年4月，已陸續與國教署召開5次協調會，大部分之經費已達共識，而未達共識項目中，主要是私校退撫基金與現職人員舊制年資等退撫經費，本項與國教署設算之經費短差約7億元。

教育局表示，經費差距7億元，勢將造成每年市庫極大之負擔，排擠現有教育預算，因此將與國教署持續爭取經費全數移撥，期改隸事宜係在確保國立高中職校務運作、資源及維護學生就學權益之前提下完成，俾南市統籌完善12年國教銜接規劃，促進教育發展。

據悉，目前臺南市轄內國私立高中職數量是6都之中最多，國立21校、私立21校，共有42校。現已升格之直轄市中，除臺北市原即管轄所屬學校無須辦理改隸外，新北市及台中市已完成改隸移轉事宜。

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